環境光センサーも HAL さんご指摘の通り主たる被写体が撮影者のいる 位置とは異なる照明を与えられている場合には問題となります。
ニコンのマニュアルを見てないので何とも言えませんが、環境光センサー の使用方法に関しては何らかの注記が有るモノと思われます。
本来なら、一度後ろを向いて、カメラを横位置にして、入射光式露出計の ようにして環境光を取り込むのが正しい使い方のような気がします。